Udbrud uden varsel at knuse roen i det japanske natteliv, en ildevarslende søjle af mørket nedstammer fra himlen. To frygtindgydende skabninger snart dukke op fra den mørke søjle, og fortsæt til udslette krigsskibe og kampfly, der kommer til at hilse deres ankomst, før man går videre til at gøre hinanden så godt. Watching transpiring begivenheder i forbløffelse er Mary og Joe Hayakawa, to forskere, der senere skulle gøre den første tur til verden uden for søjle, der snart ville komme til at blive kendt som Wonderland. En anden tur ville føre til deres mystiske forsvinden, og katalysatoren for vores nuværende eventyr at begynde. Dobbeltpumperne Hayakawa børn, Ai og Yu, opsøge de skjulte undergrundsbanen, der fører til den mystificerende verden, der ligger ud over den mørke søjle, i håb om at finde, hvor deres forsvundne forældre. Vær med dem på deres rejse er en kvinde ved navn Lisa, som tvillingerne stødt på boarding den imponerende metro toget. Vil deres rejse til Wonderland på jagt efter deres forsvundne forældre bærer frugt? Og hvad med denne mystiske mand i den sorte kappe, wielding enorm magt, og tilkalde store væsner på sin ensomme søgen mod tyranni, der griber denne mærkelige nye land?