Der Epilog "Deep Trouble - Die Jagd nach dem Fisch" hingegen setzt sich sehr kritisch mit unseren immer noch unmenschlichen Fischfangmethoden auseinander. Es wird sehr plastisch dargestellt, wie Schleppnetze die Meeresflora und Fauna zerstören, aber auch Alternativen hierzu aufgezeigt. Erst "Deep Trouble" macht "Unser blauer Planet" zu einer wirklich allumfassenden Serie über die Meere.