Steve Morrison, ein pensionierter Agent, will sich an seinem ehemaligen Arbeitgeber, der Phoenix Foundation, rächen. Verbündete sind schnell gefunden: Im Auftrag mächtiger Dunkelmänner stiehlt Steve eine Ampulle höchst gefährlicher Milzbranderreger aus US-Beständen. Die Tat bleibt nicht unentdeckt und MacGyver schaltet sich ein. Er muss unter allen Umständen verhindern, dass die Substanz das Land verlässt.