Accelerator, der sich geschworen hat, seine Fähigkeit nicht mehr gegen Sisters einzusetzen, wird von Misaka Worst, einer neuen Sister konfrontiert. Andererorts legt sich Vento, die nach ihrer letzten Niederlage ihre Spezialfähigkeit göttliche Strafe verloren hat, mit Fiamma an. Während unweit davon in einem kleinen Dorf am Rande der Allianz unabhängiger Staaten Takitsubo untersucht wird.