A Voyager különös vészjelzéseket kezd hallatni, és csak Janeway és Hétkilenced tudja az okát. A kapitány titokzatos műveletekbe kezd, de Chakotay meggyőzi, hogy mondja el a legénységnek, hogy mi történt valójában. Janeway elmondja, hogy a hajó érzékelői egy igen veszélyes, és instabil részecskére, az Omegára bukkantak. Mivel az Omega rendkívül veszélyes, a Csillagflotta utasításai szerint minden molekulát el kell pusztítani. De Hétkilenced szerint az Omega molekula stabilizálható, és tanulmányozható, ezért megint szembekerül a kapitánnyal.