Alcuni eventi molto strani iniziano ad accadere sulla Voyager: Tuvok arriva sul ponte completamente svestito, Janeway trova quattro membri dell'equipaggio mummificati in mensa, Kim subisce delle avances molto spinte da parte di Sette di Nove e la navetta di Tom Paris si schianta, uccidendolo. Fortunatamente si tratta solo di incubi, ma tutti, prima di svegliarsi, vedono nel loro sogno un alieno la cui razza non è mai stata incontrata, nemmeno dai Borg. Kim e un altro membro dell'equipaggio rimangono bloccati in uno stato di sonno profondo, dal quale neanche il dottore riesce a svegliarli. Chakotay propone allora di provare ad indagare nell'unico posto dove sembra esserci un indizio: nei loro sogni. Usando una tecnica che gli permette di controllare il corso dei propri sogni, si addormenta, alla ricerca dell'alieno che li ha contattati. L'alieno c'è, ed è ostile. Chakotay riesce però a convincerlo a non attaccarli più dicendogli che se ne sarebbero andati subito. Tutto sembra andare bene, fino a quando la nave viene abbordata dagli stessi alieni che avevano incontrato nei loro sogni. Improvvisamente, Chakotay si accorge però di stare ancora sognando...