Lion-O en de ThunderCats ontsnappen ternauwernood aan de vernietiging van hun thuiswereld, Thundera, om vervolgens een noodlanding te maken op de mysterieuze en exotische planeet Derde Aarde. Lion-O, probeert het team te leiden terwijl ze van deze planeet hun nieuwe thuis maken. Een bizarre groep wezens staat hen in de weg, waaronder de kwaadaardige Mumm-Ra, de slechte heerser van de Derde Aarde die zich door niets laat stoppen met zijn tirannieke heerschappij over de planeet.