«Секретні матеріали» закрито, Скаллі призначили викладачем в Академії ФБР, а Малдер виконує чорну роботу зі спостереження та прослушки. Після зустрічі з сенатором Метісоном, одним із його таємних друзів, що підтримують роботу над «Секретними матеріалами», Малдер не слухається наказів та їде на супутникову станцію в Пуерто-Рико до іоносферної обсерваторії Аресібо, на якій незрозумілим чином відновилася робота обладнання і це може надати докази контакту з позаземним життям.