Au cours d'un tranquille pique-nique à la plage, Scooby et ses amis voient un scaphandrier couvert d'algues sortir de l'eau. Selon le capitaine du port, c'est le fantôme d'un marin, le Capitaine Cutler, dont le bateau aurait coulé voici des années. Dès que ce fantôme vengeur surgit, des yachts disparaissent. L'équipe mène l'enquête afin de découvrir où se trouvent les yachts disparus. Une bonne partie du DA se déroule sous l'eau